最大的区别是主要成分不同。
玉米糖浆采用优质玉米淀粉,是经过多种酶水解而制得得以麦芽糖为主的糖浆,是一种无色透明粘稠的液体,低甜度。而水饴主要成分是树薯粉、水,由树薯粉加热水发酵而成,有米饴、罗仔饴、石头饴、水饴、朱饴等不同名称。