1、酸根不同
构成它们的酸根不同。而且它们的化学性质很大一部分都决定于酸根。比如无机盐一般都具有很强的亲水性，而有机盐则与某些非极性试剂有亲和力。
2、成分不同
无机盐即无机化合物中的盐类，旧称矿物质，在生物细胞内一般只占鲜重的1%至1.5%，目前人体已经发现20余种，其中大量元素有钙Ca、磷P、钾K、硫S、钠Na、氯Cl、镁Mg，微量元素有铁Fe、锌Zn、硒Se、钼Mo、氟F、铬Cr、钴Co、碘I等。
有机盐是有机酸、生物碱适当中和生成的盐，在有机结构上只有少数基团是离子的形态（羧基等），它们的作用在有机结构上，像药物、维生素等，而制成盐是为了让难以溶于水的有机物变得易溶。
