经营部和公司主要区别是：公司具备法人资格，经营部不具备法人资格属于个体户。主要区别是：
1、法人资格区别
经营部不具备法人资格，公司具备法人资格。
2、连带责任区别
经营部是无限连带责任法律，有限责任公司是有限连带责任的。
3、征收税种区别
个体户可以定额征收增值税，缴纳个人所得税等。
公司征税按实际收入征收，缴纳增值税、企业所得税等。
4、征收方式的区别：
经营部大多数是核定征收，公司一般是是查账征收。
经营部一般是税务机关根据其所在位置规模员工人数销售商品按估算的销售额予以定税.不论当月的收入多少，有无收入都要按定税金额来交税。公司则要求企业自己申报的收入来交税，小规模纳税人季度收入不超过9万元可以享受免税优惠政策
