1、岗位等级不同
研究员是自然科学研究系列岗位的一种，他（她）们通常都会培养硕士生和博士生。自然科学研究系列专业技术岗位各设置12个等级，研究员岗位设4个等级,分别对应国家通用专业技术岗位等级一级到四级， 对应于教育事业单位的教授一级到教授四级。
教授岗位分一至七级。其中正教授岗位包括一至四级，副教授岗位包括五至七级；中级岗位分3个等级，即八至十级；初级岗位分为3个等级，即十一至十三级。
2、特点不同
教授是一种高等教育体系中的职称，多指在大学或社区学院中执教的资深教师与研究员。研究员掌握着本学科领域内的国际国内最新进展，取得过高水平的研究成果，而且还要参与并完成国家或单位的重要科研任务，参与研究重要的国际合作项目。
3、任务不同
教授有教课的任务，研究员没有教课的任务。
4、工作内容不同
教授在大学里针对他们所擅长的领域开课、或授与学生专业训练，如科学和文学等领域。
研究员需要参与并完成国家重要科研任务，参与研究重要国际合作项目，负责关键技术的研发项目，参与技术交流，负责相关技术项目的标准的制定，现有研究工作的改进与完善，与研究团队人员一起进行创新产品的研发。
