简单来说，这个终极秘密就是长生。
《盗墓笔记》从头到尾的剧情安排都是跟人的寿命有关，刚开始是解释张起灵为什么可以容颜不老，到了后面又开始替吴邪治病，帮他续命。
一般来说，小说中反复出现的人物就是故事里的主角，同样小说里反复出现的故事线就是该小说的主角，而《盗墓笔记》反复出现的字眼也就是长生，所以这终极的秘密，其实就是长生的秘密。
往复杂了讲，《盗墓笔记》的终极秘密谜，是“一个终极三条迷线”
一个终极：长白山地底大铜门——中华文明的源头，伏羲古氏族文明
三条贯穿始终的迷线：第一条：史前青铜文明——蚩尤——广西——闷油瓶——失忆的一条迷之线。
第二条：盗墓笔记的大主线：古代长生秘密的发展。
第三条：盗墓笔记的大主线：现代各种力量关于长生秘密的博弈，中华文明的起点，就在长白山，这就是终极。
按正规历史的说法，中国青铜器时代始于夏朝，鼎盛于商周，但现在的史前考古，显然推翻了这点，远在远古时期，中华就出现过高度的青铜文明，有一种说法，蚩尤是史前青铜文化的创始者，而三星堆，正是蚩尤的后裔建造的。
作者南派三叔发过一个大纲，大概意思就是说：几千年前有一颗小行星撞击地球，快到地球表面的时候炸开了，其中最大的三块残骸，一块落在了长白山，被张家做成了青铜门，一块落在了西王母国，保持了最原始的模样，充满蜂窝般的孔隙，一块落在了秦岭，被做成了神树，还有一些小的残骸落在了亚洲各地，西藏有一块小残骸，被张家做成了假的青铜门。
这个陨石是一种特殊的物质，功效如秦岭神树篇所说，只要足够想要，就能得到任何东西，包括长生。是以所有残骸所落之处，都会或多或少地留有关于“长生”的传说。
能称之为“终极”是因为它关乎世界的本源，而世界本就是源源不断，也印证了长生的体现。
