吉林农业大学研究生专业有：
社会学、马克思主义基本原理、马克思主义中国化研究、思想政治教育、党的建设、社会工作、教育管理、学科教学（英语）、学科教学（体育）、化学、植物学、动物学、微生物学、生物化学与分子生物学、生态学、计算机科学与技术、环境科学与工程、制糖工程、发酵工程、粮油生物转化、农业机械化工程、农业生物环境与能源工程、农业电气化与自动化、机械制造技术、食品科学、食品安全与控制、风景园林学、新一代电子信息技术（含量子技术等）、计算机技术、大数据技术与工程、机械、资源与环境、生物与医药、作物栽培学与耕作学、作物遗传育种、种子科学与工程、菌类作物学、园艺学、农业资源与环境、植物病理学、农业昆虫与害虫防治、农药学、菌物学、生物防治、动物遗传育种与繁殖、动物营养与饲料科学、特种经济动物饲养、水生生物生产学、基础兽医学、预防兽医学、临床兽医学、草学、农艺与种业、资源利用与植物保护、畜牧、渔业发展、农业管理、农村发展、食品加工与安全、农业工程与信息技术、兽医、风景园林、粮食、油脂及植物蛋白工程、农产品加工及贮藏工程、水产品加工及贮藏工程、生药学、药理学、中药学、农林经济管理、工商管理、旅游管理等专业。
