1、品种不同
红毛丹，又名毛荔枝，红毛果，韶子，是无患子科韶子属大型热带果树;而荔枝是无患子科、荔枝属常绿乔木。两种水果是产自同科不同属的两种果树。
2、外形不同
红毛丹表面有很多毛茸茸的软刺，荔枝呈心脏形或球形，但是外面果皮具多数鳞斑状突起，呈鲜红、紫红、青绿或青白色，表面有点扎手的疙瘩。红毛丹的外壳比荔枝更硬，更厚实，手剥的话容易扎到，荔枝的壳比较薄脆，用指甲可以轻松穿透。
3、吃法不同
剥开红毛丹的外壳，会有一层白色的薄膜粘在果肉上，这是一层保护膜，这层膜，人的肠胃是无法消化的，吃到肚子里会划破肠胃内壁，食用时一定要将这层膜剔除干净。而荔枝一打开就是一个果肉，不用担心有果核膜，可以直接食用。
4、口感不同
红毛丹的果肉比荔枝吃起来更爽脆，更有嚼劲，吃起来果香味偏清淡一些，味道酸酸甜甜比较有层次感，荔枝的果肉水分更大，比较嫩滑，味道也是更纯粹的甜。
5、果核不同
荔枝的果核要比红毛丹的大，由于品种不同，两者果核是不一样的，荔枝要大一些，而有的红毛丹果核的大小只有芝麻那么大。
6、产地不同
红毛丹原产自马来半岛，如今主要在东南亚各国种植，在美国夏威夷和澳大利亚也有栽培。荔枝产于我国南方，它在我国的栽培和食用历史，现在我国有大面积种植，主要产地在广东和福建等地区。
