以下是2016年合肥公办本科院校的详细排名：
1中国科学技术大学 合肥市
2合肥工业大学 合肥市
3安徽大学 合肥市
4安徽师范大学 芜湖市
5安徽理工大学 淮南市
6安徽农业大学 合肥市
7安徽医科大学 合肥市
8安徽工业大学 马鞍山市
9安徽财经大学 蚌埠市
10淮北师范大学 淮北市
11安徽中医药大学 合肥市
12安徽建筑大学 合肥市
13安徽工程大学 芜湖市
14合肥学院 合肥市
15安庆师范学院 安庆市
16合肥师范学院 合肥市
17安徽科技学院 滁州市
17蚌埠医学院 蚌埠市
19皖南医学院 芜湖市
20黄山学院 黄山市
21阜阳师范学院 阜阳市
22皖西学院 六安市
23巢湖学院 合肥市
24滁州学院 滁州市
24淮南师范学院 淮南市
26铜陵学院 铜陵市
27宿州学院 宿州市
28池州学院 池州市
29蚌埠学院 蚌埠
