1．观察：是按生物的本来面貌反映、描述生物的状况，是科学探究的一种基本方法。科学观察可以直接用肉眼，也可以借助放大镜、显微镜等仪器，或利用照相机、录音机、摄像机等工具，有时还需要测量。科学观察不同于一般的观察，要有明确的目的；观察时要全面、细致和实时求是，并及时记录下来；对于需要较长时间的观察，要有计划，有耐心；观察时要积极思考，多问几个为什么。在观察的基础上，还需要同别人交流看法，进行讨论。如教材中的活动：观察多种多样的细胞；观察叶绿体；观察细胞的有丝分裂等。
2．实验：是人为地改变某些条件来考察生命现象的变化，以探究生命现象内在的因果关系，认识生命活动的内在规律的方法。实验的方法是自然科学研究中最重要的方法之一。如教材中的活动：检测生物组织中的油脂、糖类和蛋白质；模拟探究细胞表面积与细胞体积的关系；探究酶的.专一性等等。
3．比较：通过观察事物或事件来发现它们的相似点（类比）或不同点（对比）。比较的方法是研究不同种类生物之间关系的重要方法。如教材中对动植物细胞结构的比较；需氧呼吸和厌氧呼吸的比较；有丝分裂与减数分析的比较等等。
4．分析：把一件事情、一种现象、一个概念分成较简单的组成部分，找出这些部分的本质属性和彼此之间的关系。分析方法认为任何一个研究对象都是由不同的部份组成的，是一种机制。分析的意义在于细致的寻找能够解决问题的主线，并以此解决问题。如教材中孟德尔遗传定律的实例分析；生态系统稳态及其调节的分析等等。
5．推理：是用逻辑的合理的推断来形成能被实验验证或被事实依据支持的结论。推理建立在已知事实和观察结果的基础之上。如教材中呈现的德国人施莱登经过对植物的研究，提出了“所有植物都是由细胞组成的”；德国人施旺经过对动物的研究，提出了“所有动物也是由细胞组成的”。从而得出“所有的生物都是由一个或多个细胞组成的；细胞是所有生物的结构和功能的单位。”
6．预测：是根据现有的知识或观察到的现象推测将要发生的事件。如教材中遗传育种的实验设计，根据设计方案预测实验结果等。
7．假设：提出假设是科学探究的重要组成部分，就是根据现有知识提出问题的方案，或者是对发生某一现象作出的可能解释。我们可以通过观察或实验来验证假设，如果观察或实验结果不支持假设，则需要根据观察到的结果提出新的假设。
8．分类：是根据事物相似程度而将其分门别类。人们常将众多的物体分成不同的类别。如教材中出现的植物细胞与动物细胞、原核细胞与真核细胞；生产者、消费者和分解者；不同类型的遗传病等等。
