1、来源区别
肉蔻和豆蔻之间最大的区别就是来源不同，豆蔻来源于姜科植物圆豆蔻，是这种植物的干燥果实，而肉蔻则来源于肉豆蔻科常绿乔木，它是这种植物的干燥果仁，平时人们收取肉蔻时必须先收取植物的果实，把它的外壳去掉以后才能得到里面的果仁也是人们常说的肉蔻。
2、外观区别
肉蔻和豆蔻在外观上也有一定的区别，它的外观多为椭圆形，长度在三厘米宽度在二厘米左右，它表面的颜色多为灰色或者灰黄色。而豆蔻这种香料的外则多为圆球形，它们具有不明显的钝三棱，表面的颜色多为乳白色或者淡黄色。
3、特性区别
肉蔻和豆蔻在特性上也有一定的区别，肉蔻整体有分岐的顺纹而且外表挂白霜，它的质地坚硬不容易碎，把它破开以后能看到大理石状的花纹存在。而豆蔻的表皮为木质，特别脆平时保存时很容易从纵向裂开，它的内壁色泽很淡不过略有光泽。
4、用法不同
肉蔻和豆蔻都是常用香料，它们的主要用法就是用来炖制肉类食材，能起到提味增香的重要作用，平时肉蔻和豆蔻还能用来制作卤水，是制作多种卤味的重要原料。除了这些用法以外肉蔻还用于多种甜品的生产与加工，人们常吃的布丁和巧克力在加工时都会加入适量的肉蔻，而豆蔻却不能这样食用，这也是两者之间的重要区别。
