阿勒泰机场共有5个航司开通了7条航线,共通航8个城市,分别是中国南方航空集团有限公司,飞乌鲁木齐、喀什、伊宁;中国东方航空,飞西安;
华夏航空股份有限公司,飞库尔勒、伊宁、塔城;四川航空股份有限公司,飞重庆、西安;幸福航空,飞克拉玛依。