主要有总大肠菌群、病毒、菌落总数三个指标。
1.总大肠菌群指没升水样中所含有的大肠菌群的数目，以个/L计。大肠菌群数表明污水被粪便污染的程度。间接表明有肠道病菌存在的可能性。
2.病毒大肠菌群数可以表明肠道病菌的存在，但不能表明是否污水中有病毒。因此，还需检验病毒指标。病毒一般用噬菌体来表示数量。
3.菌落总数菌落是指细菌在固体培养基上繁殖而形成的能被肉眼识别的生长物，它是由数以万计相同的细菌集合而成。当样品被稀释到一定程度，与培养基混合，在一定培养条件下，每个能够生长繁殖的细菌细胞都可以在平板上形成一个可见的菌落。
