1982年6月,广西十万大山国家级自然保护区经广西区政府批准设立。经过防城港林业部门21年的管护后,保护区森林面积增加了2000公顷。
2002年保护区申报国家级自然保护区,2003年6月经国务院批准晋升为国家级自然保护区