没有记错的话这个拿破坏因子的洞是要等一周目通关并且主角梦醒后才会有的。
一周目通关到主角梦醒之前的剧情是这样的
打完联盟回到家之后先去水静市上方的魅影摩天楼找米可利，然后去秘密基地里找小智小茂、希罗娜、渡、阿迪克和艾莉丝对话，可以不用去对战
小智和小茂的秘密基地：通关后的115号道路，流星瀑布出口。
渡的秘密基地：通关后的120号道路。
希罗娜的秘密基地：通关后的119号道路。
阿戴克和艾丽丝的秘密基地：通关后的111号道路，沙漠上方。
搞定后回到摩天楼找米可利，再去精灵联盟和N对战，然后会触发一大段剧情，主角梦醒，之后就可以去那破坏因子的洞了。
