成年竹鼠的公母比较容易鉴别，它们与其它动物一样；公的有睾丸，母的没有睾丸，但产过小鼠的母竹鼠腹下的奶头明显。前脚还有两个奶头。
但幼鼠和没有生产过竹鼠仔的母竹鼠的公母有些也很难分清，我们只能通过察看肛门和阴户来区分，母竹鼠有肛门和阴户，肛门公母都有，而母鼠离肛门很近的位置有一个阴户，简单说就是有两个小洞，有阴户就一定是母竹鼠。上面是肛门，下面是阴户，奶头不是很明显。成年公鼠有明显睾丸凸出，当然也有少部分的公鼠睾丸隐藏了，但用手就可以摸到两粒睾丸，有睾丸是公鼠肯定不会有错。而且公鼠的生殖器离肛门口的距离大约有1.5cm左右，用手也按可以把生殖器按出来。
