主要区别如下：
1、二者作为皇宫的时间不同
西安故宫也就是大明宫，是大唐帝国的大朝正宫，始建于唐太宗贞观八年（634年）。北京故宫也就是紫禁城，是中国明清两代的皇家宫殿，于明成祖永乐四年（1406年）开始建设。
2、二者建筑风格不同
西安故宫选址在唐长安城宫城东北侧的龙首原上，利用天然地势修筑宫殿，形成一座相对独立的城堡。宫城的南部呈长方形，北部呈南宽北窄的梯形。
北京故宫布局依据《周礼·考工记》中所载：“左祖、右社、面朝、后市”的原则，建筑在北京城南北长八公里的中轴线上，南北取直，左右对称。
3、二者存在完整程度不同
西安故宫至宋代的时候，其中的的晚唐遗物要么被当地官府征为他用，要么被附近居民拆走作为建筑房屋的材料，所剩无几。
1949年中华人民共和国成立以后，对北京故宫建筑进行了大规模的修缮，同时整理出大量的文物。1961年国务院颁布故宫为全国重点文物保护单位。故宫博物院现存文物150万件（套）。
4、二者占地规模不同
西安故宫占地面积约3.2平方千米，是明清北京紫禁城的4.5倍，被誉为千宫之宫、丝绸之路的东方圣殿。
北京故宫以三大殿为中心，占地面积72万平方米，建筑面积约15万平方米，有大小宫殿七十多座，房屋九千余间。是世界上现存规模最大、保存最为完整的木质结构古建筑之一。
