1．短期保存方法
新鲜的香菇不要沾水，以免腐烂，伞朝下柄朝上放在保鲜袋里，扎几个透气孔，放在冰箱里冷藏，可保鲜一星期左右。新鲜香菇在5℃左右可以保存15天左右，但是由于在运输途中已经受到损伤，这个保鲜期会缩短，所以在冰箱中最好储藏不要超过一周，最佳食用期应该在3天以内。
2．长期保存方法
若想长期保存，可直接将新鲜的香菇放入保鲜袋，挤去空气，放进冷冻室冷冻一夜；第二天拿出来时会发现香菇已脱掉水分，只有表面留有水分及保鲜袋上留有密密的小水珠。这时，把香菇拿出来，用纸片吸掉香菇表面的水分之后，装进另一个干净的保鲜袋，重新放入冰箱冷冻保存。这样处理之后，新鲜香菇就变成可以直接烹饪的冻干香菇了。
注意事项：如果发现香菇水分比较多（菇伞颜色偏黑），不要急于将香菇放进冰箱保存，摊开香菇放置于阴凉的地板上晾晒几个小时，待菇伞颜色变成灰色后或显得干燥后再放进冰箱储存；任何时候发现香菇菇伞发黑就应该丢弃，发黑的香菇就已经变质了，其气味也有所变化，如果有发黑的香菇要及时丢弃，因为混在一起会影响其它的香菇。
