一、本质属性不同，沉香是需花费多年时间才能形成的油脂与木质的混合物，而檀香这是檀香树的芯材，是一种木质。并且沉香的油脂含量越高则品质就越好，甚至到达一定程度会出现沉水的情况。
二、沉香和檀香在味道上存在大不同，不仅是散发的味道有差异，在散发的形式也很不同，沉香的香味是由所含油脂挥发所散出的，而檀香则是木质直接发出香气。并且沉香散发出的味道温和内敛、留香非常持久，而檀香散发出的浓郁典雅，比较奔放。
三、珍贵程度上不同，沉香相对檀香来说是要更珍贵，主要是沉香的数量比檀香要少上许多，而且一块沉香的形成需要成千上百年，而檀香则较为常见。
四、价格上来说，沉香总体上的价格高于檀香很多的，甚至一块沉香能达到百万的价格，而檀香的价格就较为平常一些。
