怀孕50天的时候,胎芽大小一般在2到5毫米之间。怀孕50天的时候,胎芽刚刚形成,胎芽的大小跟受孕时间早晚有关,如果受孕比较早的话,胎芽会大一些,如果受孕比较晚的话,胎芽会相对小一些,但这都是正常的,不用担心,以后做好定期检查就可以了。