事业单位辞职,档案会永久保存。你进事业单位,要通过组织人事部门组织的统一招考。录用后,组织人事部门就建立了你的个人档案,记录你在单位的工作情况,职位变动、工资调整、年终绩效考核等都会记录。你如果辞职,档案仍然会永久保存,不会丢弃毁坏。