轨道三号线，西起天生港，东至苏通园区，全长41.1公里；轨道四号线为南北走向，从金沙南到市开发区江山路，全场约38.4公里。在四条轨道沿线，将分别设置青年路站枢纽、南通东站枢纽、苏通产业园站枢纽、锡通产业园站枢纽，南通大学站枢纽等11处换乘枢纽。
三号线:华能路->黄海路->长平路(i1)->长泰路->永怡路(i2)->工农路北->国强路->335省道->钟秀路东->人民路东->通甲路->汽车东站(i2)->洪江路东->南通大学(i1)->花园路->常青路->通富南路->路->能达商务区(i1)->星宇路->张江路->玉兰大道->锡通南区(i4)
