总大肠菌群是指一群需氧及兼性厌氧菌,在37℃生长时能使乳糖发酵,在24小时内产酸、产气的革兰阴性无芽孢杆菌。总大肠菌群主要包括畅杆菌科中韵埃希氏菌属、柠檬酸绑菌属、魔雷伯氏菌属和肠杆菌属，这些属的细菌均来自于人和温血动物的肠道，需氧与兼性厌氧，不形成芽孢;在35~37℃条件下，48 小时内能发酵乳糖声酸产气，革兰氏阴性。
该菌与医学细菌学分类中的大肠杆菌不同。它包括肠杆科的四个菌属:艾希氏菌属、柠檬酸杆菌、克雪伯氏杆菌以及副肠杆菌。
总大肠菌群能够辅助合成多种维生素，例如维生素B族，维生素K族，而且还能够增强自身的免疫系统。
