由于氢键是一种较弱的相互作用,磷酸二酯键是一种较强的相互作用,所以在加热的时候可以使得氢键断裂,而磷酸二酯键不断裂。
此外,DNA解旋酶,RNA聚合酶都可以使得氢键断裂;而限制性核酸内切酶可以使得磷酸二酯键断裂