阿米巴是企业内部划分为多个独立经营单元，通过内部定价和内部交易，实现各经营单元独立核算，核算各单元的边际利润，通过创造的边际利润给经营单元做激励分配，最终实现每个经营单元成本最小化、利润最大化，以确保企业的盈利。
阿米巴经营以心为本，兼顾长期利益与短期利益，阿米巴的绩效考核不予工资直接挂钩，在老板与员工之间建立信赖。阿米巴的绩效考核回归阿米巴经营原点，回归绩效的真正意义——培养阿米巴经营人才与阿米巴经营循环改善。企业推行阿米巴经营，如果不匹配科学的绩效考核体系，也就难以取得好的效果。
阿米巴经营模式通过制定出年度、月度经营计划，让各个阿米巴组织有了明确的自主经营目标，确定了获得整体认同的企业绩效分析及评价系统，并以此为基础构建基于公司整体绩效的员工个人绩效考核方案，让阿米巴的一切经营行为直接应对组织绩效的改善。
阿米巴领导人、员工的个人收益也与公司的整体利益挂钩，全公司上下形成目标共同体、利益共同体，将激活了员工的经营意识和主动性，打造激情四射的集体，依靠全体智慧和努力完成企业经营目标，实现企业的飞速发展。
