本部是四个校区的,
1.同济大学四平路校区,是主校区。
2.同济大学嘉定校区,地址:上海市嘉定区曹安公路4800号。
是复旦大学的四大校区之一,俗称医学院校区,位于繁华的徐家汇东侧。
3.同济大学沪西校区,地址:沪西校区位于上海市普陀区真南路500号。
校区占地面积414亩,校舍总面积30.2万平方米,包括新建设的现代化学生公寓5.2万平方米。按照学校资源配置与校区布局规划,同济大学浙江学院大三安排在沪西校区就读。
4.同济大学沪北校区,地址:同济大学沪北校区位于上海市中山北路727号(共和新路口),
1958年创建上海铁道医学院。 1995年5月上海铁道学院与上海铁道医学院合并成立上海铁道大学。