分子晶体主要包括有机分子晶体和金属有机框架晶体（MOFs）。
分子晶体是由分子之间的弱相互作用力形成的晶体结构，具有多样的结构和性能。
其中，有机分子晶体由有机分子构成，是有机晶体学领域的主要研究对象；而MOFs则由金属离子桥连有机配体构成，具有高表面积、可控的孔隙和与之相关的吸附、分离和催化性质等特征，在材料科学、化学等领域得到了广泛的关注。
除了有机分子晶体和MOFs以外，还有染料敏化太阳能电池中常见的卤化物钙钛矿（halide perovskites）、小分子有机半导体晶体等，这些分子晶体都在材料科学中具有重要应用价值。
