12个平方米可以办食品经营许可证的。食品经营许可证,是对经营预包装食品,包括烟酒饮料,饼干糕点等包装好的食品商品。12个平方米的面积,是完全可以办一个小型日杂食品便民商店的,所以也完全可以办食品经营许可证,并登记注册营业执照,经营各种预包装食品。