亚麻需要大量的氮和钾以及少量的磷肥，施肥是一种灵活有效的措施，调节营养和生理过程，可以影响到亚麻的产量和质量。亚麻生长期不同肥料的吸收不均匀，生长初期氮素需求量比较的高，丛型期需氮量比较多，快速生长期和开花期需钾量较高，在开花期需要更多的磷。过量施用氮肥会导致亚麻的倒伏，容易感染病害和降低出麻率，过量的磷肥会导致植物矮小并过早的老化。
亚麻是一种根系发育较弱、吸收能力差的作物。因此，施肥应以基肥为主，辅以追肥，使氮、磷、钾和微量元素结合。要求每亩施用1000公斤分解的有机肥，40公斤的亚麻专用复合肥，并在缺锌的地块中加入2公斤的硫酸锌。为了防止亚麻的倒伏，可以添加草木灰，追肥的情况应取决于亚麻的生长，以及生长不佳的田地。当亚麻植株高10厘米时，尿素的施用量为每亩10公斤左右，追施的太晚或太早，容易造成亚麻成熟晚，生长期长，容易引起亚麻的倒伏和返青，给收获和储存带来很大的困难。
