核反应堆是一种以放射性燃料棒缓慢裂变来提供EU（Energy Unit）的发电机。
同样，燃料棒在反应堆中产生能量的同时也会产生热量。热量可以通过种种冷却手段来消除。如果冷却不足，反应堆会逐步过热，最终发生爆炸。铜质导线对于基础的，发电量不大的反应堆来说已经足够，但反应堆更高级，需要的导线等级也就越高。每个有燃料棒会在反应堆中持续反应10000秒（2h47min）。一个铀燃料棒至少提供5eu/t的能量（每个铀单元至少提供总共一百万EU）。一块铀矿石在良好的处理下可以产生总共七千三百万EU。可以通过在核反应堆的六面上安置核反应仓来扩大反应堆的反映空间。在IC2 EXP中，程序员已经将核反应堆完全重编程，以近衰变铀棒为基础的增值反应堆已经从系统中删去。唯一没有改变的只有堆芯熔毁。同时，在IC2 1.3.2中反应堆系统又进行了一次整改，添加了一些新的物品，移除了环境因素对反应堆散热的影响，如冰块与水对反应堆的散热效果
