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食品级焦亚硫酸钠微弱毒性。我国规定可用于蜜饯、饼干、食糖、冰糖、饴糖、糖果、葡萄糖、液体葡萄糖、竹笋、蘑菇和蘑菇罐头,最大使用量0.45g/kg。
焦亚硫酸钠用于生产保险粉,磺胺二甲基嘧啶、安乃近,己内酰胺等;用于氯仿,苯丙砜和苯甲醛的净化。