1、概念区别：
益生菌是从有益宿主健康出发给出的定义，是一类对宿主有益的活性微生物总称，而乳酸菌是一类能利用可发酵碳水化合物产生大量乳酸的细菌的通称。
2、成分种类区别：
益生菌包括了部分乳酸菌，而乳酸菌不全是益生菌。目前益生菌的四种菌种有乳酸菌、芽孢杆菌、酵母菌、光合细菌等几大类。而乳酸菌中对人类生活有益的乳酸菌有双歧杆菌等，但也有一些乳酸菌对人体是有害的。
3、功能作用区别：
益生菌和乳酸菌都具有调整肠道菌群平衡的作用，不过益生菌全部对身体有益，而乳酸菌有部分可能对人体有害。乳酸菌和益生菌都是对人体肠道起调节作用的菌群，功能上相差不多，只不过益生菌都是对人体有益的，而部分乳酸菌对人体可能有害，益生菌和乳酸菌均可以添加在酸奶中，供人们食用。
