要在公众号自动回复中添加小程序，您需要使用微信公众平台的开发者工具进行设置。具体步骤如下：
1. 登录微信公众平台，在左侧菜单栏中选择“开发-开发者工具”。
2. 在开发者工具页面中，点击“自定义菜单”或“自动回复”，进入相应的设置界面。
3. 在“编辑自动回复”页面中，点击右上角的“+添加规则”，进入规则编辑页面。
4. 在规则编辑页面中，您可以设置关键词、回复内容、回复类型等信息。如果您想添加小程序，则可以在“回复内容”中选择“小程序”，并填写小程序的AppID、页面路径等信息。
5. 完成设置后，点击“保存”即可保存规则并生效。
