1、腹部区别：首先，侧颈龟区分公母可以看它们的腹部。观察它们的腹部，若是上面有一条明显的直线、并且它们腹部的中央有非常明显的凹陷进去的部分，那么就是公龟；如果腹部比较平坦的话，就是母龟。
2、尾巴区别：公龟和母龟的尾巴区别也是比较大的。从尾巴的长度来看，公龟的尾巴长，而母龟的尾巴短。从尾巴的粗度来看，公龟的尾巴粗，尤其是尾巴的基部，看起来是非常粗的；而母龟的尾巴则比较细。
3、泄殖孔区别：还可以观察它们泄殖孔德位置。如果是公龟的话，那么它们的泄殖孔距离它们腹甲的后面边缘会比较远；母龟则相反，它们的泄殖孔距离腹甲边缘比较近。
4、体型区别：公龟和母龟在成年之后的体型也是不同的。母龟在成年之后的体型一般来说会比公龟大一些。不过，若是从这个方面来比较，则需要在它们成年之后才能进行。
