哈密瓜的施肥以施有机肥为主，再配施一些化学肥料。有机肥以商品有机肥为主(农家肥要进行熟化处理)；化学肥料以氮、磷、钾三元复合肥为主。施肥量以667 m 产4 000 kg哈密瓜计算，要施商品有机肥2 000 kg，并配施l5—15—15的45％三元复合肥80—120 kg，同时根据当地的实际适当增施一些其他微量元素肥。
哈密瓜对氮、磷、钾肥料需求在各个生育阶段有所不同。在出蔓前对磷肥需求较多；出蔓后至结瓜前只要有一定量氮、磷肥就可以正常生长。结瓜后，特别是瓜长到鸭蛋大小以后，需要大量的氮素肥料供植株和果实生长。当果实长足后，果实表皮开始拉出网纹，这段时间对钾肥的需求开始提高，如果钾元素施用量跟不上，就会对果实品质造成很大影响。
