通过主打吴三桂，安抚其他藩王的方式，用了8年时间。
1673年（康熙十二年）春，康熙皇帝作出撤藩的决定。吴三桂首先于这年11月杀云南巡抚朱国治，自称天下都招讨兵马大元帅，提出“兴明讨虏”，将矛头指向朝廷。
吴三桂军由云、贵而开进湖南，几乎占据湖南全省。进而占据四川，四川官员纷纷投降。福建、广东、广西、陕西、湖北、河南还有台湾的明郑等地都有汉官、汉兵和少数民族上层人士，一些地区的农民、奴仆都迅速响应。
此后，吴三桂在湖南沿江布置防御工事，不再向北发展，康熙帝抓住机会调整战略、安排兵力。
他首先坚决打击吴三桂，而对其他的反叛者却实行招抚，通过分化力量而孤立吴三桂。军事上仅以湖南为进攻的重点，同时能够充分信任汉将，这样就鼓舞了朝廷军队的士气。
在耿精忠、尚之信归顺清廷之后，吴三桂于1678年（康熙十七年）在衡州称帝，立国号周，建元昭武，大封诸将。
其实这时的吴三桂已到了穷途末路。他积郁而死后，将所谓的“帝位”传给孙子吴世璠。 1681年（康熙二十年）冬，清军进入云南省城昆明，吴世璠自杀，历时8年的三藩之乱被平定。
