黄花鱼是硬骨鱼纲鲈形目石首鱼科黄鱼属中的鱼，而大黄鱼是硬骨鱼纲鲈形目石首鱼科黄鱼属大黄鱼种的鱼。可见，二者最大的差异就是所指的范围大小不同，黄花鱼所指的范围比较大，包含黄鱼属之中所有的鱼，而大黄鱼所指的范围则比较小，指的仅仅是黄鱼属大黄鱼种中的鱼。因此，我们可以说所有的大黄鱼都是黄花鱼，但并非所有的黄花鱼都是大黄鱼。
在黄鱼属之中，除了大黄鱼种之外，还有小黄鱼这个种。大黄鱼跟小黄鱼相比也是不同的。从外观来看，大黄鱼的头部以及眼睛等部位都比较大，但小黄鱼与之相比则头部、眼睛比较小。另外，二者在我国分布的地域也是不同的。大黄鱼分布在我国比较偏南的海域之中，小黄鱼则生活在我国比较偏北的海域之中。
