首先，除了特殊疾病等原因，每次为锦鲤换水无需全部更换。一般每隔3-5天就为其更换四分之一或者三分之一水源，在吸出水族箱内的粪便、鱼食残饵等有害物质。然后在缓缓的向水族箱中加入新的，无氯气水源。
其次，当鱼儿患上某种疾病时，就需要更换水族箱内的全部水源。全部换水时要先拔掉水族箱的电源插头，同时准备新的无氯气水源，将捞出的锦鲤先放在其中饲养。然后在将水族箱中的旧水吸出，将水族箱中的假山假石等一切物质取出，进行清洁消毒。将水族箱的四壁冲刷干净，并用少量的淡盐水浸泡消毒。一切消毒完毕后在清水将其冲洗干净，在向水族箱中缓缓的注入新水源，将水温水质调节到锦鲤适合生活的状态，在将锦鲤放入其中饲养即可。
最后，在给锦鲤换水时动作要轻柔缓慢，打捞锦鲤时也需谨慎小心，不要伤害到锦鲤，注入新水的也要缓慢轻柔，不可用力冲刷，水应该从水族箱的四壁缓缓注入，不可直接冲刷在锦鲤身上，以免伤害到锦鲤的体表。
