1、落叶不同：牡丹属于落叶小灌木或亚灌木，高度大多在2米以下；而野牡丹则属于常绿小灌木，有的品种可高达3-5米，甚至7米。
2、植株不同：牡丹的根圆柱形或具纺锤形的块根，当年生分枝基部或茎基部具数枚鳞片；而野牡丹的茎四棱形或近圆形，通常被毛或鳞片状糙伏毛。
3、叶片不同：牡丹的叶通常为二回三出复叶，小叶片不裂而全缘或分裂、裂片常全缘；野牡丹叶对生，被毛，全缘，具叶柄。
4、花朵不同：牡丹单花或数朵顶生或茎上部叶腋，花朵硕大，直径都在4厘米以上，萼片3-5，花瓣有单瓣重瓣等多种；野牡丹花单生或组成圆锥花序顶生或生于分枝顶端，花瓣5，花朵较小。
5、花色不同：牡丹由于栽培历史久远，园艺品种繁多，因而花色极为丰富；而野牡丹由于很少园艺栽培，杂交品种少，因而花色大多为淡红色、紫红色至红色。
6、花果期不同：牡丹花期4月~5月，果期6月；野牡丹花期5-7月，果期10-12月（品种不同花果期不同）。
7、分布不同：牡丹野生主要分布在甘肃、陕西、山西、河南、安徽、湖北、四川、云南、西藏等9个省区；而野牡丹属主要分布在长江流域以南，其中野牡丹主产云南、广西、广东、福建、台湾。
