1、木兰春色园
面积约9.4公顷，主要以木兰科植物及杜鹃花科植物为主，形成满园春色的景观效果。该园已收集有植物200余种，其中包括观光木、鹅掌楸、凹叶厚朴、天目木兰、乐东拟单性木兰、宝华玉兰、望春玉兰、川含笑、紫花含笑、新含笑等特色植物。为了纪念宁波镇海籍植物学家钟观光先生(我国第一个植物园的创办者)，在本园中设立了钟观光科普馆。
2、樱花海棠园
面积约为13公顷，以展示蔷薇科樱属樱花、苹果属海棠等植物为主。樱花和海棠是早春重要的观花树种，盛开时花繁艳丽，如云如霞。园中已收集有染井吉野、大寒樱、修缮寺寒樱、钟花樱、兰兰、神代曙、小松乙女、米国、江户彼岸、阳春、大渔樱、红豆、郁金及八重红枝垂等樱花品种30余种;以及垂丝海棠、白花垂丝海棠、西府海棠、木瓜海棠、木瓜、贴梗海棠、北美海棠等海棠品种。
3、水湿生植物区
是植物园重点打造的专类园之一，面积约4.9公顷。以杉科耐水湿的水杉、落羽杉、中山杉等为基调树种，广泛收集了适合宁波地区生长的水湿生木本及草本植物，形成杉岛、杨柳岛、乌桕岛及鸢尾岛等优美独特的景观，同时在林中布置了栈道及观景平台，给人以丰富的游憩体验。
4、槭树秋香园
面积约6.1公顷，园内以槭树科、漆树科及金缕梅科等植物为主，结合杜鹃、景石及溪流，打造秋季独特优美、色彩绚丽的自然景观。目前已收集樟叶槭、娜塔栎、紫果槭、秀丽槭、茶条槭、血皮槭、红翅槭、日本红枫、鸡爪槭、野漆树、北美枫香及金叶香樟等植物达60余种。
5、兰园
占地面积约1.3公顷，四面环水，通过桥梁与植物园区联接，在保留老建筑的基础上，借鉴了宁波当地古建筑的风格修葺而成;其古朴雅致的中式院落和优美环境，为人们提供了一个品味兰花文化的好去处。
6、百合园
面积约0.6公顷，上层植物以布迪椰子、中东海枣、加拿利海枣、华盛顿棕榈等棕榈科植物为主，下层植物主要展示百合、朱顶红、郁金香、风信子、葡萄风信子、洋水仙、石蒜、百子莲及大花葱等球根类花卉。
7、竹园
面积约为1.5公顷，主要展示竹类植物品种。园中已收集有竹子品种70余种，包括散生竹如毛竹、花毛竹、斑竹、紫竹、红壳竹、甜竹、金镶玉竹、乌哺鸡竹、早竹、龟甲竹、橄榄竹、桂竹等;丛生竹如孝顺竹、凤尾竹等;混生竹如茶杆竹、方竹、苦竹、菲白竹等。
