小智拥有的宠物有：
1、喷火龙喷火龙是火恐龙在与化石翼龙战斗时进化的，随后喷火龙便不再听从小智，并因此使小智在神奇宝贝联盟石英大会的八分之一决赛时输给了阿弘。在一次被冰冻后，小智的悉心照料终于感动了喷火龙。喷火龙也成为了小智的主力。在EP135中，为了让喷火龙更好的修行，小智将它留在了喷火龙山谷。在城都联盟白银大会与对战工厂的比赛中，喷火龙都发挥了重要作用。
2、卡比兽卡比兽是小智在椰子群岛中因为胖丁的歌声加上皮卡丘的十万伏特而收服的大胃王，在橘子联盟决赛之前，小智将它留在了大木研究所。后来它参加过神奇宝贝相扑大会，并获得优胜，结果一下子吃光了奖品一年的食物。后来卡比兽还参加过挑战对战开拓区的比赛。
3、皮卡丘小智最初的伙伴，具有顽强的性格，不愿意进入神奇宝贝球，起初与小智并不友好，在与烈雀的战斗中和小智建立了坚不可摧的友情。在皮卡丘离开小智的时候，它就负责起照看其他神奇宝贝的任务。除了小智一行人的神奇宝贝外，最要好的朋友就是一对皮丘。最初在EP001中出现。
4、蜥蜴王是森林蜥蜴在AG160中保护喜爱的大菊花时进化成为蜥蜴王，而后丧失了一切技能。在恢复后，蜥蜴王变得十分强大。并且成为小智必不可少的主力。
5、叉尾浮鼬在DP034中，小智一行人去河边钓鱼，碰到专门通过战斗抢走钓竿的叉尾浮鼬，后被小光收服。在DP055中，由于喜欢小精灵对战而和喜欢华丽大赛的长尾怪手进行交换，给了小智。
6、小火猴原本是真嗣的神奇宝贝。在DP050中,小智和真嗣建立起搭档关系分别使用皮卡丘和小火猴参加双人合作赛大会。在DP051中，小智和真嗣晋级了半决赛，可是，小火猴的战斗状态却怎么也调整不好，面对这种状况，真嗣竟然将小火猴放生！见此状况，目睹了一切的小智说着『一起旅行变强吧』，将小火猴收服了。在DP052的总决赛，小智用小火猴参赛并获胜，得到安逸铃铛。之后再与真嗣的战斗时进化成了猛火猴，并且学会了音速拳。
