先说结论,秦日纲背叛韦昌辉的原因如下,秦日纲是太平天国的燕王,韦昌辉是太平天国的北王,韦昌辉,秦日纲等人发动了天京事变,将东王杨秀清朱砂他们受到了天王洪秀全的猜忌,因此,秦日纲为了拯救自己的家人,他就背叛了韦昌辉,并且杀进了北王府。