公元1227年八月廿五日，成吉思汗病死在六盘山，享年66岁.对于成吉思汗的死因，历来说法很多，主要有四个版本。据《蒙古秘史》记载，在出征西夏前1年，成吉思汗的身体状况已经出现问题。一次打猎时，从马背上摔下受伤，并发起高烧。当时进攻西夏的计划已定，因成吉思汗身体不适，考虑退兵。
但在使臣交涉过程中，西夏将领出言不逊，致使成吉思汗大怒伤身而一病不起，他抱病出征。最终虽然灭亡了西夏，成吉思汗也死在军营里。
此外，曾经于13世纪40年代出使蒙古的罗马教廷使节普兰诺·加宾尼，在其传世的著作中说成吉思汗是被雷电击中身亡。
而著名的意大利旅行家马可波罗留下的记载中称，成吉思汗是在攻城时中箭而死。
最离奇的一个说法见于清朝成书的《蒙古源流》，该书中又说成吉思汗俘虏了美丽的西夏王妃古尔伯勒津郭斡哈屯，这位王妃在侍寝时刺伤成吉思汗，然后投黄河自尽，成吉思汗也因伤重不治而亡。目前，史学界和考古界对于成吉思汗的死因，大多倾向于《蒙古秘史》上的记载。
