隆庆皇帝有四个儿子。
1、宪怀太子朱翊釴
嘉靖三十四年（1555年）出生，嘉靖三十八年（1559年）去世，时四岁，赠封裕世子，隆庆元年（1567年）追封为宪怀太子。
2、靖悼王朱翊铃
朱翊铃（1562－1562），明穆宗第二子、母不详。朱翊铃不足一岁就夭折，被赠封蓝田王，隆庆元年（1567年）追封为靖悼王。
3、明神宗朱翊钧
明神宗朱翊钧（1563年9月4日-1620年8月18日），明朝第十三位皇帝，明穆宗朱载垕第三子，生母孝定太后李氏。隆庆二年（1568）三月十一日被立为皇太子，正位东宫。隆庆六年（1572年），明穆宗驾崩，10岁的朱翊钧即位，年号万历，在位48年，是明朝在位时间最长的皇帝。
4、潞简王朱翊镠
朱翊镠（1568年3月3日―1614年7月4日），明穆宗朱载垕第四子，明神宗朱翊钧同母弟，生母孝定太后李氏，隆庆四年（1570年）二岁时受封潞王。居京师二十年，朱翊镠受尽恩宠，万历帝曾赐其田地万顷。万历十七年（1589年）二十二岁时就藩卫辉府。
在藩二十六年，在王位三十五年。万历四十二年（1614年）孝定太后去世，讣告到卫辉，朱翊镠悲痛不已，不久即病逝。年四十七岁。谥号简王。
