电影《流感》结局是:孟瑟身上的抗体在美日身上得到了存活,美日被救,总统也成功抵制住了下属还有外国等势力的压迫,美日身上的抗体被医生提取制成了药品,韩国的病毒得到了控制,而姜智久和金仁海也因为经历了重重困难在一起了。