主要区别是，性质不同、过程不同、设置地点不同，具体如下：
一、性质不同
1、垃圾收集
垃圾收集，是生活垃圾从被投放开始，经收集到被运至中转站或处理场的过程。
2、垃圾转运站
是在垃圾产地（或集中地点）至处理厂之间所设的垃圾中转站。
二、过程不同
1、垃圾收集
混合收集主要有三种方式，一是将收集容器放置于固定的地点，如居民小区、街道两侧，以及其他公共场所。每天有专门的环卫人员负责收集这些容器里的垃圾。二是在居民小区建有固定的垃圾收集站，居民每天可以把生活垃圾扔到垃圾站。三是垃圾道，在高层住宅楼中，垃圾道在建楼时就已经设计好了，从一层一直直通到顶层，居民可以把垃圾扔进垃圾道，环卫人员从底层拿走。
2、垃圾转运站
收集到的垃圾由专门的垃圾车运到垃圾转运站。垃圾被运到转运站后要进行第一步处理。首先由分类机进行分类，被分为有机物和无机物，以及可利用的和不可利用的。对于大体积的垃圾还要进行压缩处理。之后，这些垃圾被分类运走。
三、设置地点不同
1、垃圾收集
主要在居民区、商业区等城区范围内。
2、垃圾转运站
转运站的选址应符合城市总体规划和城市环境卫生行业规划的要求，转运站的位置宜选在靠近服务区域的中心或垃圾产量最多的地方，条转运站应设置在交通方便的地方。在具有铁路及水运便利条件的地方，当运输距离较远时，宜设置铁路及水路运输垃圾转运站。
