三羧酸循环的反应过程如下：
（1）乙酰CoA和草酰乙酸缩合成柠檬酸，反应由柠檬酸合酶催化。
（2）柠檬酸转变成异柠檬酸。
（3）异柠檬酸转变成α-酮戊二酸，反应由异柠檬酸脱氢酶催化。
（4）α-酮戊二酸氧化脱羧生成含有高能硫酯键的琥珀酰CoA，反应由α-酮戊二酸脱氢酶复合体催化。
（5）琥珀酰CoA转变为琥珀酸，琥珀酰CoA的高能硫酯键水解，生成GTP，反应可逆。这是底物水平磷酸化的又一例子。
（6）琥珀酸脱氢生成延胡索酸，由琥珀酸脱氢酶催化，辅酶是FAD.
（7）延胡索酸生成苹果酸。
（8）苹果酸生成草酰乙酸和NADH+H+.这是三羧酸循环的最后一步反应，反应可逆。
