制作骨骼标本，必须要去掉皮肤和肌肉、内脏，保留骨骼和鱼鳍。要使骨骼和鱼鳍保留正常状态，还必须保留连结骨骼和鱼鳍及鳍条间的韧带。处理时用开水煮烫材料，便于剔除肌肉和鱼皮肤。方法是：用大口锅盛水烧开，并保持沸腾状态，两手戴干棉手套，以防水蒸汽烫伤手，双手分别握住鱼头和鱼尾，将鱼躯干部分浸入沸水中，先烫一侧，2～3分钟后再烫另一侧，时间相同，最后将整条鱼全部浸在水中，约1分钟后捞出。
热处理的程度与标本制作的质量好坏有密切关系。热处理时间过少则剔除肌肉时费事且效果不好，过多则骨骼之间的连结韧带易被烫熟，骨架易散落而难以组装，因此应注意以下问题：
（1）热处理的时间长短应视鱼的大小而异，大鱼时间长，小鱼时间短。若鱼鳞较大，可先用刀把鱼鳞刮去，然后再烫。
（2）整条鱼在沸水中浸烫的时间不宜过长，以刚好能撕下头部皮肤为度。时间长了头部骨骼和鱼鳍易被煮坏而脱落。脱落下的头部骨骼是不易修复原位的。
（3）从沸水中捞鱼应用笟篱或其他合适的工具，直接牵拉鱼头、鱼尾或鱼鳍则很易损坏标本。
（4）若不能掌握一次煮烫的程度，可在保证鱼头骨骼和鱼鳍不被烫坏的情况下的多次煮烫，即烫后剔去一部分肌肉，然后再烫一次。
3．剔除肌肉
由于鱼的骨骼细小，不可能将骨骼、韧带处的肌肉全部剔除干净，但要尽可能剔除干净。腹中内脏要在腹壁肌肉去掉后再清除，不要损伤肋骨。剔除肌肉是一项细致的工作，不能粗心大意，要在了解鱼身体结构，特别是骨骼结构的基础上进行操作，要心细手轻，避免损伤骨架。
剔除肌肉的顺序是先躯干部，再尾部，最后处理头部和鱼鳍。剔除肌肉时要注意保护好鱼头、鱼鳍及鳍担骨，头部只去掉鳃盖骨外的肌肉，除特别需要外，鱼头部外层骨骼听覆盖的肌肉不要处理。
（1）粗剔用镊子沿骨骼方向轻轻撕下鱼体腹尾部肌肉，只留脊椎及肋骨，不与脊椎相连的肌肉间小骨刺一同去掉。臀鳍的支鳍骨与尾椎的脉棘相连，应注意保护。要将腹鳍和腰带一同取下，单独剔除其肌肉和皮肤。体型较大的鱼可以用刀由背部向腹部割去大块肌肉，然后用刀，镊剔除附在骨骼上的肌肉。
（2）细剔用小镊子和手术刀仔细地剔除附在骨骼上的小块肌肉，特别是头部后面和椎骨上面的肌肉，越净越好。不要让刀损伤骨骼，细小的部位可以用毛刷（最好用牙刷）在水中轻轻地刷去肌肉。
（3）处理头部及鱼鳍这两部分主要是去掉皮肤。浸烫过的标本头部和鱼鳍上的皮肤可以用毛刷刷去，头部骨骼外的肌肉可以用镊子夹去。鱼口和眼眶部位的骨骼细小，容易损伤，因此用刷要轻，去掉皮肤即可。刷鱼鳍的皮肤时，毛刷要顺着鳍条的方向，由内向外轻轻洗刷，以防弄断鳍条，造成不可挽回的损失。
4．腐蚀肌肉
这是上一步的继续。刀、镊和毛刷很难把附在骨头上的肌肉剔除干净，剩下的少量肌肉要再用碱处理一次，使骨骼更干净。
将标本浸入0.5～1％的氢氧化钠溶液中浸12～24小时。处理过程中应经常观察标本的变化情况，在骨骼上残存的肌肉透明后，再继续处理，约相当于前面处理所用的1/4时间后即捞出，用清水浸洗，然后再用毛刷刷去残存的肌肉和皮肤。
碱对肌肉的腐蚀作用很强，在碱处理过程中必须经常观察处理的进展情况。处理时间过长，碱会把连结骨的韧带、肌健全部溶化，使骨架变成一堆碎骨，失去利用价值，前功尽弃。
5．脱脂
（1）脱水将标本上的水沥干，经95％和乙醇各2～3小时，脱去标本中的水（骨骼较大的标本加长处理时间）。或用自然干燥法脱水。
（2）脱脂将标本浸入二甲苯或汽油中脱脂1～2天。
（3）复水自然干燥后放回水中或经乙醇和95％乙醇回到水中。
6．漂白
用（双氧水）2～3％或0.5％的水溶液浸泡标本12～24小时，在标本开始发白时取出，用清水洗净。
7．整形装架
标本的整形与装架可一步进行，也可以先整形，待标本干燥硬化之后再装架。
（1）整形装架一步完成取长度大于鱼总长1/3，宽15厘米，厚1.5～2厘米的木板作为台板。将鱼骨架放在台板中央，在台板上标出鱼头后缘、腹鳍和尾鳍三个部位的位置。在台板上标出的三个部位上打0.2厘米的小孔。用直径0.1厘米的细铁丝缠绕脊柱的前后两个部位及腹鳍，然后固定在台板上。由于没有干的标本易变形，装好后的标本还要在背鳍、脊柱上系4～5根棉线，向上拉起，使标本呈。等标本干燥，形状固定后去掉棉线即可。
（2）先整形后装架取大于鱼长的或软木板及许多长针（牙签也可）。用两根针前后卡住鱼头，把鱼骨架吊在的一侧，变形的部位用针固定成。干燥后去掉针，取下标本进行装架。在台板上标出鱼头后缘、腹鳍、尾椎中部三个位置，打上直径为0.3厘米的小孔。取同样粗的竹签插在小孔中，用标本分别确定三个支柱的高度，截好后将上端切成平面，加上一滴（或），然后轻轻放上标本。临时固定标本，干胶后去掉固定架即可。
若标本制作过程中有部分肋骨脱落，要注意保管，并一同处理完全过程。在标本装好架干燥后，用粘到原位上去。最后，贴上标扦标明标本。
