1、职能的不同。
公路局的职能包括交通收费、征管、规划、建设、养护等。目前,在事业单位改革中,管养分离,维持企业经营;交通运输局的职能包括负责道路、水港、水路、地方铁路等交通运输业的管理、运输收费、征管、规划、建设和维护。