LFY转录因子基因家族是一类非常重要的基因家族，能够促进细胞增殖和花发育。对于该基因家族系统演化的研究有利于探索植物演化过程中的花发育。之前的研究在LFY基因家族中鉴定到了一个中间态以及一次基因复制事件，但该基因家族早期的演化轨迹仍不清楚。
基于链型植物所有主要支系的LFY基因，通过极大似然法和贝叶斯法重建了LFY基因家族的系统演化。高分辨率的系统发育树揭示了在地钱、苔藓和维管植物的祖先中I类和II类LFY基因功能分化前存在一次复制事件，说明了一个古老混杂基因的亚功能化。
在紫萁蕨属植物中鉴定到的混杂基因说明LFY基因经历了一次古老的瞬间复制。基因组共线性比较揭示了LFY基因在基因组位置上的高度保守性，并且禾本科植物中发生过一次谱系特异性的转位事件。
