种植水空心菜的时候，建议选择口径稍大的容器，例如水缸一类的器皿，以陶瓷、玻璃、水泥类的容器为宜，避免使用塑料容器，否则塑料老化后会释放各种有害物质，被水空心菜吸收后危害人体健康。
水空心菜种植后不能长时间浮在水面，需要用浮水材料固定其根部，保持顶梢向上，否则植株可能被水泡烂，无法成活，最环保的浮水材料为竹子编的篱笆网，或者使用泡沫板，无孔的材料则要按照行株距打孔。
在市场上购买优质的水培空心菜品种，然后把叶子摘掉，只保留梢部的2片叶，再把浮水材料放进容器中，并将处理好的空心菜插进浮水材料的孔中，每个孔一根菜苗，每根菜苗保持3-4节露出水面。
